基因搜
基因搜是国内拥有基因数最多、种属最齐全的网路基因数据搜寻平台，用户可以在这个平台上搜寻其所需的任意基因的信息。同时，为了丰富该库的内容，该库中还补充了部分载体库、shRNA库、microRNA库、启动子库、细胞库、抗体库等生物资源，合称七大生物资源库。
基本介绍
- 中文名：基因搜
- 特点：基因数最多、种属最齐全
- 分类：cDNA克隆库、Vector库等
- 性质：网路基因数据搜寻平台
主要特点
1、种属齐全：人、小鼠、大鼠及其它大部分种属；
2、数量众多、内容丰富：包括收集了五万多条cDNA的cDNA克隆库、涵盖了多个国外着名生物公司的两百多种载体的Vector库、shRNA干扰效率高达80%的shRNA库、囊括了pre-miRNA和pri-miRNA的microRNA库以及收藏了数百种细胞的Cell库；
生物资源库搜寻引擎
生物资源库搜寻引擎3、检索便利、信息全面：只要一个关键字或一个编号就可以直接检索到所有相关信息，同时系统会自动进行筛选和排序，择优最先显示。突变少，序列正确率高。
详细介绍
cDNA克隆库
cDNA克隆库是整合了国外数个cDNA库资源后推出的一个功能强大、数据完善的cDNA克隆库。该cDNA克隆库收集了人类、大鼠和小鼠等种属的五万多条cDNA，且序列正确率高。
Vector库
已有六百多种出自Promega、Stratagene、Clontech、Invitrogen、Ambion、Novagen、NEB等着名生物公司的载体，原核表达、真核表达、酵母双杂交、报告载体、克隆载体等各种用途，所有载体均可提供测序报告（用载体上的通用引物测序），保证和官方提供的序列完全一致。
shRNA库
TRC（RNAi协会）专业出品，针对人及小鼠近万个基因，总数达五万多条（每个基因3~5条shRNA）的shRNA库。经过大规模实验验证，其中超过90%均为有效shRNA，其干扰效率均大于80%（大多数超过90%）。
MicroRNA库
既有pre-miRNA库，也有pri-miRNA库。其中pre-miRNA库较全，拥有近四百个已经发现的pre-miRNA形式的microRNA。pri-miRNA库中的microRNA数量稍少。
Cell库
该库中收藏了数百种细胞的全部信息，其中以目前最热门的肿瘤细胞为主，主要是针对生物医学领域而设定的。
启动子库
启动子库有380多种常用启动子，包括广谱表达型启动子、组织特异性启动子、肿瘤特异性启动子、定製启动子等多种形式。
如何选择
cDNA还是ORF
| cDNA克隆 | ORF克隆 | |||
|---|---|---|---|---|
非表达型 | 表达型 | 非表达型 | 表达型 | 表达型（+大提） |
常见载体 | ||||
pOTB7 | pCMV-SPOT6 | pUC57 | 自选 | 自选 |
产品特点 | ||||
全长序列，含有5’和3’ UTR 载体多为克隆载体 无表达框，保证CDS区序列正确，同NCBI | 全长序列，含有5’和3’ UTR 基因片段位于表达框中，CMV启动子调控 保证CDS区序列正确，同NCBI | 基因ORF序列 Kozak序列，增强基因表达 两侧有合适酶切位点，便于后续亚克隆操作 完全测序，保证序列正确，提供测序报告 详细的构建报告 | 基因ORF序列 Kozak序列，增强基因表达 载体自选，多种载体多种标籤可选 可直接用于蛋白表达 完全测序，保证序列正确，提供测序报告 详细的构建报告 | 基因ORF序列 Kozak序列，增强基因表达 载体自选，多种载体多种标籤可选 可直接用于蛋白表达 完全测序，保证序列正确，提供测序报告 详细的构建报告 提供转染级大提质粒，可直接用于细胞转染 |
产品不足 | ||||
客户需自己做基因克隆实验 后续实验繁琐，且可能会出错，无法获得满意的基因表达载体 费时费力 | 虽可直接用于表达，但是5’ UTR序列可能会形成複杂二级结构，影响基因的表达效率 | 无法用于蛋白表达，需通过基因克隆装载至合适的表达载体 | 小提质粒，无论是纯度还是浓度都不适合用于细胞转染 客户需自己做质粒大提 | |
BC还是NM
- 经费充足时，建议选NM_xxxxxx
- BCxxxxxx和NM_xxxxxx两者CDS区相同时，可以选BCxxxxxx
- BCxxxxxx和NM_xxxxxx两者CDS区不同时，以NM_xxxxxx为準
小鼠和大鼠基因通常只有BCxxxxxx的克隆产品
| BCxxxxxx | NM_xxxxxx |
|---|---|
NIH-MGC Project产品 序列、载体等信息均完全同NCBI 序列同cDNA而不是同genome，与NM_xxxxxx序列有时候存在差别 大部分克隆的CDS区序列同NM_xxxxxx 价格通常比NM_xxxxxx便宜 |